江藩嘉慶間入粵為阮元幕僚，阮元出資刊刻《漢學師承記》，以顧炎武、黃宗羲深入宋儒之室，多騎墻之見，故僅得忝列卷末；后又刊《宋學淵源記》，然不錄自詡宗程朱的桐城方苞、劉大櫆、姚鼐。方東樹與江藩同在阮元幕府，對此大為不滿，故撰《漢學商兌》以駁之。
　　其書仿朱熹《雜學辨》體例，先摘錄原文，復各為辨正于下。卷上首先為理學、道學正名；卷中之上回應漢學家對宋學義理的批駁；卷中之下集失于漢學家之治學方法，引錢大昕、戴震、段玉裁、孫星衍等人由小學入義理之說而一一駁斥，認為尚音韻訓詁名物制度只是小學內(nèi)事而非大學，不可由此得義理之真；卷下取江藩《國朝經(jīng)師經(jīng)義目錄》有關(guān)論述一一辯駁。
　　方東樹從弟方宗誠頗受曾國藩、李鴻章賞識，盛推《商兌》，因而大行于世。然至清末民初則批評之聲轉(zhuǎn)多，皮錫瑞謂其純以私意肆其謾罵。平心而論，書中雖有牽強之處、謾罵之語，但針砭漢學，亦有切中其病者，至于辨阮元師、儒之分，下啟近代章太炎、錢穆等人學說，亦不可沒其功。
　　《漢學商兌》最早刊本為道光十一年辛卯冬刊本，后又有同治十年望三益齋刻本、六安求我齋刻本，光緒八年華雨樓重校本等。大要可分為兩個系統(tǒng)：一以道光十一年刊本為祖，一以同治十年望三益齋刻本為源。前者較后者篇幅略少，蓋因望三益齋本經(jīng)由方宗誠等人整理，將成于道光十八年之《刊誤補義》一卷逐條插入道光本并有所刪削。今以同治望三益齋刻本為底本，并參校道光本及《漢學商兌刊誤補義》民國抄本，施以新式標點。原書中避諱字徑改，不出校記。
　　本次出版平裝版，整理者又訂正了少量訛誤。