本書(shū)圍繞地球上已知微生物種類、數(shù)量等，按不同宿主、不同生境下微生物分類展開(kāi)介紹，同時(shí)也從微生物與人的關(guān)系、發(fā)現(xiàn)評(píng)估微生物的技術(shù)發(fā)展以及微生物的變異中體現(xiàn)不斷變化的、多彩的微生物世界。主要內(nèi)容包括：第一部分：地球上微生物知多少第二部分：微生物和人類第三部分：發(fā)現(xiàn)和評(píng)估微生物的技術(shù)及進(jìn)步第四部分：我國(guó)存在多少種微生物野生動(dòng)物微生物蟲(chóng)媒微生物食品動(dòng)物微生物寵物微生物食品微生物第五部分：極端環(huán)境微生物青藏高原微生物冰川微生物極地微生物海洋微生物第六部分：微生物的變異
本書(shū)由中國(guó)工程院院士、醫(yī)學(xué)微生物學(xué)專家徐建國(guó)院士領(lǐng)銜編寫(xiě)。本書(shū)從三個(gè)層次（地球上的微生物、我國(guó)存在的微生物、不同宿主不同生境中的微生物）由面到點(diǎn)，不斷深入具體；從三個(gè)維度（微生物與人、發(fā)現(xiàn)評(píng)估微生物的技術(shù)以及微生物的變異）體現(xiàn)不斷變化的、多彩的微生物世界。不僅是對(duì)醫(yī)學(xué)相關(guān)領(lǐng)域愛(ài)好者的科普，也為相關(guān)專業(yè)人士對(duì)微生物的認(rèn)識(shí)打開(kāi)新視野。
長(zhǎng)期以來(lái)，人類應(yīng)對(duì)新發(fā)傳染病威脅的策略始終處于被動(dòng)狀態(tài)。究其根源，核心癥結(jié)在于微生物是人類肉眼看不見(jiàn)的引發(fā)傳染病的病原微生物，人類無(wú)法用肉眼直接觀測(cè)到。傳統(tǒng)應(yīng)對(duì)模式遵循事件驅(qū)動(dòng)路徑：當(dāng)傳染病疫情暴發(fā)后，研究者需先假設(shè)是由某種病原微生物引起的，通過(guò)培養(yǎng)、分離等驗(yàn)證流程，并遵循科赫法則，確認(rèn)病原微生物，繼而展開(kāi)診斷、治療和防控研究。這種應(yīng)對(duì)模式存在明顯滯后性，其本質(zhì)是馬后炮式的被動(dòng)反應(yīng)，根源在于很長(zhǎng)一段時(shí)間人類缺乏發(fā)現(xiàn)新病毒、新細(xì)菌的能力。在技術(shù)受限時(shí)期，病原微生物的鑒定高度依賴體外培養(yǎng)技術(shù)。當(dāng)遇到無(wú)法培養(yǎng)的微生物時(shí)，研究進(jìn)程便停滯。值得慶幸的是，核酸測(cè)序技術(shù)的革命性突破徹底改變了這一局面。新一代測(cè)序技術(shù)使研究者無(wú)須依賴傳統(tǒng)培養(yǎng)手段，即可直接獲取病毒或細(xì)菌的全基因組信息。對(duì)基因組數(shù)據(jù)的解析不僅突破了科赫法則的限制，更推動(dòng)了病原學(xué)診斷進(jìn)入基因組時(shí)代新型冠狀病毒感染疫情的病原學(xué)診斷范例，標(biāo)志著病原微生物研究進(jìn)入主動(dòng)認(rèn)知的新紀(jì)元。地球上存在巨量微生物，絕大多數(shù)是未知的。這些微生物有多少？在哪里？以什么方式存在和運(yùn)動(dòng)？我們?nèi)绾尾拍軌蚺c微生物和諧相處，并科學(xué)應(yīng)對(duì)它們的挑戰(zhàn)？造成這些挑戰(zhàn)的核心問(wèn)題為微生物是人類肉眼看不到的。所以，本書(shū)的目的是和大家一起研討地球上有多少微生物，以及它們?cè)谀睦铩Ｗ兓奈⑸镉袃蓚�(gè)含義。一是微生物世界本身在變化。隨著環(huán)境的改變，能在變化的環(huán)境中生長(zhǎng)繁殖的微生物的種類和數(shù)量會(huì)發(fā)生巨大變化�？墒�，我們?nèi)庋劭床坏竭@種變化。二是我們大腦中關(guān)于微生物的認(rèn)知在發(fā)生重大變化。關(guān)于微生物的新知識(shí)，在快速、巨幅增長(zhǎng)。過(guò)去我們堅(jiān)持的真理，也許今天看來(lái)根本就是錯(cuò)誤的。這些都會(huì)嚴(yán)重影響我們的判斷和行為。開(kāi)展未知微生物調(diào)查，是人類健康生存所必需的，是主動(dòng)防控未來(lái)新發(fā)傳染病所必需的。本書(shū)是承擔(dān)中國(guó)工程院重大戰(zhàn)略咨詢項(xiàng)目（人類傳染病第三次重大轉(zhuǎn)變發(fā)展趨勢(shì)預(yù)測(cè)及應(yīng)對(duì)策略研究）的專家們，通過(guò)學(xué)習(xí)、交流、思考，形成的關(guān)于人類生活環(huán)境中微生物的初步認(rèn)知，發(fā)表出來(lái)，和大家共享。人們處于對(duì)肉眼看不見(jiàn)的巨量微生物的不斷認(rèn)識(shí)的過(guò)程中，難免會(huì)呈現(xiàn)出很多不正確或者不準(zhǔn)確的地方，希望得到大家的幫助和指正。本書(shū)書(shū)名由楊永法先生題字，特致謝。
徐建國(guó)，醫(yī)學(xué)微生物學(xué)家，中國(guó)工程院院士，傳染病預(yù)防控制國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室主任。從事新發(fā)傳染病研究43年，主持完成九起有較大影響的不明原因暴發(fā)疫情的病原學(xué)調(diào)查，包括1999年蘇皖大腸桿菌O157:H7、 2005年流腦4821序列群、2005年豬鏈球菌序列7型、2006年人粒細(xì)胞無(wú)形體病等， 為疫情處置明確了方向，也在JAMA（2008）、Lancet（2006，2013）、Nature(2003,2016,合作)等雜志發(fā)表SCI論文300篇。 2018年提出反向病原學(xué)理論和主動(dòng)防疫思想，發(fā)現(xiàn)和命名了100種新細(xì)菌、20種新病毒。 2020年初，任衛(wèi)健委檢測(cè)結(jié)果初步評(píng)估專家組組長(zhǎng)，建議把病原體確定為新型冠狀病毒。 牽頭一篇參與6篇新冠防控咨詢建議，被中辦國(guó)辦采用。2022年主持聯(lián)合國(guó)生物武器濫用實(shí)驗(yàn)室核查能力測(cè)試X傳染病項(xiàng)目。
第一章新發(fā)傳染病的物種交集學(xué)說(shuō)一、變化的微生物二、從導(dǎo)致疫情發(fā)生的偶然因素和結(jié)局的角度對(duì)傳染病進(jìn)行分類參考文獻(xiàn)第二章微生物王國(guó)一、病毒是地球上數(shù)量*多的生命物質(zhì)二、細(xì)菌的世界：地球細(xì)胞生物的主宰三、真核微生物的多樣性四、古菌的多樣性五、生命暗物質(zhì)生命樹(shù)(tree of life)的完善和微生物暗物質(zhì)的發(fā)現(xiàn)本章結(jié)語(yǔ)參考文獻(xiàn)第三章微生物和人的關(guān)系一、微生物和生命起源二、人類與病原微生物的長(zhǎng)期博弈：歷史上的生存之戰(zhàn)三、人體微生物四、人類活動(dòng)與病原微生物的跨物種傳播參考文獻(xiàn)第四章對(duì)微生物王國(guó)的認(rèn)知取決于技術(shù)一、形態(tài)學(xué)時(shí)代：微觀世界的啟蒙二、微生物分離的時(shí)代：多樣性的解鎖三、微生物組學(xué)：微生物群落的全貌四、挖掘微生物世界：從病毒到微生物組學(xué)五、人工智能：微生物學(xué)的新視野參考文獻(xiàn)第五章食品動(dòng)物攜帶的病原微生物和未知微生物一、家畜攜帶的微生物二、家禽攜帶的攜帶的微生物三、野生動(dòng)物攜帶的微生物四、食品動(dòng)物攜帶的微生物參考文獻(xiàn)第六章野生動(dòng)物攜帶的病原微生物和未知微生物一、野生動(dòng)物：自然界中龐大的病原微生物儲(chǔ)存庫(kù)二、野生動(dòng)物攜帶的微生物：已發(fā)現(xiàn)的只是冰山一角三、野生動(dòng)物中發(fā)現(xiàn)的新型微生物：認(rèn)識(shí)遠(yuǎn)遠(yuǎn)不足四、野生動(dòng)物與病原微生物五、野生動(dòng)物源性病原微生物的跨種傳播鏈條六、病原微生物為何從野生動(dòng)物傳播到人？七、保護(hù)野生動(dòng)物就是保護(hù)我們自己參考文獻(xiàn)第七章寵物攜帶的病原微生物和未知微生物一、人間大瘟疫黑死病的暴發(fā)二、犬瘟熱病毒引發(fā)的犬界瘟疫三、貓瘟病毒引發(fā)的貓界瘟疫四、上呼吸道的雙重夾擊：貓瘡疹病毒與貓杯狀病毒五、幼犬大致病威脅：犬細(xì)小病毒六、寵物中的冠狀病毒七、致使恐懼的傳播：狂犬病毒八、寵物口中的微生物：你不知道的其他威脅九、貓抓病揭秘：巴爾通體十、寵物體內(nèi)潛伏的寄生蟲(chóng)：弓形蟲(chóng)與利什曼原蟲(chóng)十一小貓皮膚的微妙挑戰(zhàn)：通過(guò)愛(ài)貓傳染貓癬十二、異寵與人類共生：倉(cāng)鼠、鸚鵡、蛇、蜥蜴等異寵帶來(lái)的健康挑戰(zhàn)十三寵物攜帶的未知微生物參考文獻(xiàn)第八章吸血昆蟲(chóng)攜帶的病原微生物和未知微生物一、吸血昆蟲(chóng)主要種類及可能攜帶的病原微生物和未知微生物二、蚊蟲(chóng)攜帶病原微生物的多樣性及其傳播風(fēng)險(xiǎn)三、蜱類攜帶病原微生物的多樣性及其傳播風(fēng)險(xiǎn)四、蚤類攜帶病原微生物的多樣性及其傳播風(fēng)險(xiǎn)五、吸血蠓攜帶病原微生物的多樣性及其傳播風(fēng)險(xiǎn)六、其他吸血昆蟲(chóng)攜帶的病原微生物參考文獻(xiàn)第九章青藏高原野生動(dòng)物未知微生物和病原微生物一、全球第三次鼠疫大流行可能來(lái)源于青藏高原喜馬拉雅旱獺二、喜馬拉雅山脈形成的假說(shuō)三、青藏高原野生動(dòng)物攜帶的微生物大多是未知的四、青藏高原重要的野生動(dòng)物五、青藏高原野生動(dòng)物未知微生物評(píng)估參考文獻(xiàn)第十章海洋存在巨量未知微生物和病原微生物一、海洋存在特殊的微生物二、海洋微生物的潛在風(fēng)險(xiǎn)三、海洋生物攜帶的病原微生物參考文獻(xiàn)第十一章冰川未知微生物和病原微生物一、全球冰川分布及變化二、中國(guó)冰川的分布、類型及變化三、冰川微生物分布四、冰川微生物釋放的潛在風(fēng)險(xiǎn)五、人類活動(dòng)與冰川微生物釋放的潛在風(fēng)險(xiǎn)參考文獻(xiàn)第十二章極地未知微生物和病原微生物一、極地生態(tài)環(huán)境與生物圈二、極地微生物探索三、極地病原微生物探索：極地環(huán)境可能是病原微生物的天然冰箱四、人類活動(dòng)與極地傳染病風(fēng)險(xiǎn)參考文獻(xiàn)第十三章微生物變異和傳染病流行一、微生物的變異二、微生物變異對(duì)傳染病流行的影響參考文獻(xiàn)第十四章環(huán)境微生物一、空氣中的微生物二、水體中的微生物參考文獻(xiàn)
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